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现已分离到7个致病种 ，其中以卡氏棘阿米巴（A．castellanii）为多见。棘阿米巴入侵途径尚不完全清楚，已知可从皮肤伤口、穿透性角膜外伤、损伤的眼结膜或经呼吸道 、生殖道等进入人体 。 棘阿米巴角膜炎的症状与其他许多普通眼部感染症状相似 。症状会持续数周至数月 ，各人所表现出的症状不尽相同 ，其主要表现如下：眼痛 、眼红肿、视力模糊 、对光敏感 、眼睛有异物感、多泪 。眼睛感染棘阿米巴的患者不会觉察到感染在体内的扩散 。
棘阿米巴可以引发严重的，甚至是致死性的脑部感染和被称为“肉芽肿阿米巴脑炎 ”的脊索感染 。一旦发生了此感染 ，患者会出现头痛 、颈部僵硬 、反胃呕吐、疲惫 、思维混乱 、对周围的人和环境缺乏反应、失去平衡感及对身体的控制 、癫痫和出现幻觉等症状。病程超过数周 ，患者通常会死亡 。 尽管感染非常罕见，但隐形眼镜使用者感染棘阿米巴角膜炎的风险较大 。隐形眼镜使用者的如下行为会增加感染棘阿米巴角膜炎的风险：
隐形眼镜的保存和操作不规范 。
隐形眼镜消毒不规范 (比如使用自来水或自制液体去清洗隐形眼镜) 。
戴隐形眼镜游泳 、热水盆浴或淋浴 。
接触受污染的水 。
有角膜外伤史 。
2012年9月 ，英国科学家警告称 ，棘阿米巴虫若寄生在隐形眼镜上，可能最终导致眼瞎 。并指出大多数人由于不注意隐形眼镜卫生 ，用自来水清洗或戴着隐形眼镜洗澡都可能染上该虫。寄生虫会啃食角膜 ，导致眼痒、流泪、视力模糊 、怕光 、眼睑肿胀并且非常疼痛。
由棘阿米巴引发的皮肤感染或扩散病患多发生于免疫系统不完善者或有慢性病的人群中 。 眼睛和皮肤的感染一般是可以治疗的 。如果怀疑自己眼睛或皮肤感染了棘阿米巴，应去咨询医生。当确诊后，药物治疗是非常有效的 。药物治疗应采用联合用药的方式 ，在治疗的不同阶段用药方法也不同 。
多数的脑部和脊索棘阿米巴(肉芽肿阿米巴脑炎)患者会死亡。
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